Поиск продуцентов биологически активных веществ в природных субстратах
мы ищем антибиотики ! это круто !
Сколковский Институт Науки и Технологий
Tilda Publishing
Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова
Проблема и актуальность
Одним из самых эффективных способов производства антибиотиков является использование актинобактерий, которые производят примерно две трети всех известных антибиотиков.
Поэтому нашей целью стало проверить эффективность выбранной стратегии по выделению продуцентов биологически активных веществ.
Резистентность возрастет из-за активного и бесконтрольного использования антибиотиков в промышленности и медицине.
В Российской Федерации каждая пятая инфекция вызывается бактериями, которые устойчивы к тому или иному антибиотику. А ежегодно выявляется около 47 млн случаев таких заболеваний.
Гипотезы
Мы рассчитываем оценить выбранной стратегии и выделить наиболее активные штаммы бактерий-продуцентов.
Филогенетическое древо для наиболее активных продуцентов, выделенных нами
Новые штаммы актинобактерий, выделенные из неизученных природных сред, дают перспективы для их дальнейшего использования в различных областях биотехнологии и в фармакологии, а именно - для создания новых лекарственных соединений.
Решение и результаты
Мы используем запатентованную репортерную систему на основе рекомбинантных штаммов E.coli для определения механизмов действия продуцируемых антибиотиков.
Помимо этого у данных штаммов нарушены механизмы защиты, что повышает восприимчивость их к антибиотикам.
После мы провели скрининг целевой активности чистых культур с помощью метода блоков и выделили: 7 сильноактивных, 12 среднеактивных, 10 малоактивных и 2 неактивных штамма.

Проверка целевой активности чистых культур методом блоков
Проведенный электрофорез на ПЦР 16S региона штаммов
Чем же мы все-таки занимались
Микробиологический посев
Для исследования были взяты 3 субстрата: почва, морские осадки и растительный субстрат.
Также мы приготовили 3 различных питательных среды: орг 79, Гаузе 1 и Чапека, в которые добавили антибиотики для ингибирования роста грибов и грамотрицательных микроорганизмов.
Выделение чистых культур
Мы выделили чистые культуры продуцентов по морфологическим критериям и вырастили их на твердых средах и в жидких культурах. Затем мы исследовали их свойства.

Скрининг целевой активности
Репортерная система на основе рекомбинантных штаммов E.coli работает так: антибиотики, добавленные в общую среду, нарушают процессы жизнедеятельности репортерного штамма, что запускает каскад реакций, индуцирующий синтез репортерных белков : Katushka и rfp, по свечению и зоне лизиса которых, можно определить перспективность штамма.
Идентификация актинобактерий
После изучения культуральных, морфологических и физиологических признаков, а также после секвенирования, мы наконец-то можем составить филогенетическое древо, найти информацию по близкородственным штаммам, и
провести анализ соединений, продуцируемых ими.

Визуализация процесса работы над проектом и результатов проекта
Планы
1
Продолжение поиска продуцентов биологически активных веществ
2
Использование найденных веществ для прямого применения или синтеза новых антибиотиков
3
Спасение мира йоу
Наша команда
Мун Анастасия
Участник проекта
Милованов Артем
Участник проекта
Сидоров Михаил
Участник проекта
Ермакова Соня
Участник проекта
Хотимская Дарья
Участник проекта
Рыбка Анастасия
Участник проекта
Закалюкина Юлия
Наставник
Бирюков Михаил
Наставник
Фотоотчет
Направление "Генетика и персонализированная медицина"
Контакты
8(915)293-03-89
ermakova3669@mail.ru