28 июля 2021 года

Проект "Azotobacter"

Всероссийский конкурс научно-технологических
проектов "Большие вызовы"

Об исследовании
Азотфиксирующие бактерии играют важную роль в агроэкосистемах. Видовой состав этих бактерий, а также особенности генов фиксации азота пока изучены недостаточно. Результаты реализации проекта помогут разработать основу биологически активных препаратов, имеющих важное значение для сельского хозяйства, позволив сократить использование синтетических удобрений, резко ухудшающих качество почв и приводящих к ее деградации.

"Участники «Охотников за микробами» уже собрали образцы почв вблизи различных растений на Адлерской опытной станции Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н. И. Вавилова. Во время смены школьникам предстоит определить микробный состав почвы, выделить бактерии и проанализировать их видовой состав."

Седых Сергей Евгеньевич
методист направления;
ИХБФМ СО РАН

3
научных организации
Способствуют проведению
данного исследования на базе ОЦ "Сириус"
104
часа
усердной работы в лаборатории
9
человек
объединил данный проект для работы над ним

Организации партнеры

Руководители
Седых Сергей Евгеньевич
Руководитель направления
ИХБФМ СО РАН
Парамоник Анастасия Павловна
Руководитель проекта; ИХБФМ СО РАН
Смирнова Наталья Валентиновна
Руководитель проекта; к.б.н. ИПА СО РАН
Воронина Елена Николаевна
Научный консультант проекта; ИХБФМ СО РАН

В результате реализации проекта будет проведен анализ видового состава бактерий (ПЦР и секвенирование), а также анализ генов фиксации азота. Будут построены филогенетические деревья по генам 16S рРНК и ферментов нитрогеназ, предложены и апробированы способы определения эффективности азотфиксации бактерий в условиях лаборатории.
Смирнова Наталья Валентиновна., ИПА СО РАН


Участники исследования
Кащенко Григорий
г. Санкт-Петербург
Евдокимова Валерия
г. Калининград
Трофимов Андрей
г. Краснодар
Манюрова Аделина
г. Москва
Богдан Арсений
г. Сыктывкар

Azotobacter
Ход исследования
5-28 июля

1
5 июля
Начало подготовительных работ: структурное изучение проблемы и возможных путей ее решения.
2
6-10 июля
Сбор материалов и выдвижение предполагаемых гипотез: начало формирования "бактериального банка".
3
11 июля:
первая предзащита
Подведение итогов прошедшей недели. По плану выполнено: анализ содержания CO2, NO3 в почвенных образцах; регулярное измерение влажности инкубируемых почв. Засев питательной среды с целью получения колоний микроорганизмов.
4
12-16 июля

Идет активная работа с растущими колониями: начало молекулярно-микроскопических опытов.
5
17 июля:
вторая предзащита
Подведение итогов прошедшей недели. По плану выполнено:
Создание микроскопических препаратов на основе бактерий, взятых из сформировавшихся колоний; проведение ПЦР с различными образцами и постановка электрофореза с полученными продуктами.
6
18-26 июля
Подведение итогов проделанной работы; окончательный анализ и дальнейшее картирование полученных данных.
7
27 июля:итоговая защита
8
28 июля:конференция


Итоговый отчет
Нашей командой было выполнено и проанализировано:
68 микробиологических препаратов
В ходе различных экспериментов с целью более точного анализа было решено провести окраску по Граму полученных образцов.
Более 100 реакций ПЦР
Создания филогенетического дерева найденных организмов требует наличие генетического материала в необходимом количестве, целью чего и является данная процедура.
Филогенетическое дерево
Было построено на основе данных секвенирования всех выбранных образцов ДНК.
Более 20 литературных источников
Анализ и процессинг полученных данных подразумевает глубокую работу с уже имеющимися научными и литературными данными.

Остались вопросы?
Свяжитесь с нами!


28 июля 2021 года
Олимпийский проспект., дом 1., Сочи
Контакты:
galaxys32015795@gmail.com
acnoagnagn.3@gmail.com