Подсолнечник 3.0

Подсолнечник 3.0 под прицелом: новые гены-мишени управляемого ветвления

Подсолнечник 1.0 Подсолнечник 2.0 Объект исследования
17,2 млн тонн
валовой сбор
в России
11,1 млн га
площадь посева
16,6 ц/га
Урожайность
Яркий подсолнух крупным планом
агропромышленные и биотехнологии
Наши партнеры

Актуальность проекта

Точнее. Быстрее. На уровне генов.

Цветущие подсолнечники в поле
3–5 лет может занимать ожидание результата при традиционном подходе

Тип ветвления напрямую влияет на практическую ценность растения

  • Урожайность
  • Гибридизация
  • Технологичность

Традиционный подход

Почему традиционная селекция подсолнечника неэффективна?

  • Долгий процесс: приходится ждать 3–5 лет, пока растения вырастут

  • Результаты зависят от погоды и других внешних условий

  • Отбор идёт только по внешнему виду и урожайности уже взрослых растений

Предлагаемое решение

Генетические маркеры:



  • Позволяют определить нужные свойства на ранних стадиях развития

  • Ускоряют селекцию и сокращают время ожидания результата

  • Повышают точность отбора.

Цель проекта

Апробировать маркеры, ассоциированные с ветвлением у подсолнечника, на образцах из коллекции компании-партнёра

  • Ожидаемый результат:
    Предполагается сформировать коллекцию валидированных маркеров и подготовить практические рекомендации для реализации маркер‑опосредованной селекции подсолнечника по типу ветвления

    • Задачи
    Подбор праймеров
    Разработка праймеров для ПЦР и ПЦР-РВ на основе SNP, выявленных с помощью методов GWAS
    Выделение ДНК и оценка её качества

    Получение образцов тотальной ДНК из растительного материала, измерение концентрации, чистоты и целостности для последующего молекулярно-генетического анализа

    Апробация маркеров на коллекции подсолнечника компании RUSEED

    Тестирование ДНК-маркеров, ассоциированных с признаком ветвления, на образцах из коллекции компании-партнёра и проверка их достоверности

    Предложение собственных маркеров

    Разработка новых молекулярных маркеров, пригодных для эффективного отбора перспективных генотипов подсолнечника в селекционных программах

    Подробнее о методах






    Этапы работы

    1. 01

      Анализ литературы

      Поиск генов-кандидатов и существующих молекулярных маркеров в научных источниках

    2. 02

      Подбор молекулярных маркеров

      Работа в программах UGENE, Primer-BLAST, использование базы данных NCBI для дизайна маркеров

    3. 03

      Выделение ДНК

      Экстракция ДНК с помощью набора компании СИНТОЛ «ДНК-Экстран-3»

    4. 04

      Оценка концентрации ДНК

      Качественная оценка — электрофорез в агарозном геле. Количественная оценка — спектрофотометр NanoDrop

    5. 05

      Статистическая обработка результатов

      Использование критерия хи-квадрат Пирсона (χ²) для оценки достоверности ассоциаций

    Результаты исследования
    • Подобрали праймеры
      Разработали праймеры для ПЦР и ПЦР-РВ на основе SNP, выявленных с помощью методов GWAS
    • Выделили ДНК и оценили её качество

      Получили образцы тотальной ДНК из растительного материала для последующего молекулярно-генетического анализа


    • Апробировали маркеры на коллекции подсолнечника компании RUSEED

      Протестировали ДНК-маркеры, ассоциированные с признаком ветвления, на образцах из коллекции компании-партнёра и проверили их достоверность

    • Предложили собственные маркеры

      Разработали новые молекулярные маркеры, пригодные для эффективного отбора перспективных генотипов подсолнечника в селекционных программах

    Наша команда
    • Зайкова Диана
      КГАНОУ "Краевой центр образования", г. Хабаровск
      zajkovadianka@gmail.com
    • Радченко Олег
      Лицей-интернат “Эрудит”, г. Донецк
      olegradch2010@gmail.com
    • Телеганов Максим
      МБОУ СОШ №50 г. Калуга
      teleganov.m.a@mail.ru
    • Титова Виктория
      ГБОУ СОШ №2 п.г.т. Усть-Кинельский
      v.titova24@mail.ru
    • Ярына Мария
      ГБОУ ЛНР “КУВК №5 “Перспектива” имени Героя СВО М.В. Снитко, г Красный Луч
      mariayarinna@gmail.com
    • Субханов Линар Рустамович
      руководитель проекта, сотрудник департамента инноваций компании RUSEED
      lsubxanov@bk.ru
    • Гереева Евгения Исламовна
      ассистент, магистрант НТУ Сириус

      zhenyagereeva@gmail.com

    • Мельникова Милена Сергеевна

      стажер, студентка НТУ Сириус
      unstablesunflower@yandex.ru
    Работа над проектом